DNA亲子鉴定中心网站-欢迎您!

我是谁?我来自哪里?亲子鉴定高级版,基因芯片技术及优缺点介绍

       近些年,在美国有个搞个人基因检测的公司特别红火。红火到把美国的FDA(药监局)都惊动了,硬生生叫停了很多项目,生怕他把基因检查玩坏了,惹出社会麻烦来。


      这个公司就是鼎鼎大名的23 and me,没被一巴掌拍死的项目不多,其中就包括“祖源鉴定“的基因检测服务。这个检测非常有意思,是用来帮人找祖宗的。他能够告诉你祖先有哪些,分别是哪里人,在什么年代通过什么样的途径,到过哪里,最后定居在哪里,很好玩。
 
      这种“我是谁?我从哪里来?”的问题中国人通常不太在意,反正不是陕西就是河南,撑死了这么几块地方,有啥好查的。但是对于老美这种移民国家就不一样了,不做不知道,一做吓一跳,特别有意思。比如说有个世代黑人的家庭,检查完后才发现压根就没有黑人血统,而是以黄种人血统为主;属于先到东亚大陆,然后再逐渐迁到东北,再一路 北上到西伯利亚,然后趁着太平洋结冰的时候飘过白令海峡到阿拉斯加,最后才穿过加拿大到美国。听着就有一股子史诗感,适合拍大片,好刺激的样子。投奔自由最后被奴役被屠杀,连祖宗是哪里来的都搞不清了,结局也挺主旋律。


 
我们国内也有做这种祖源鉴定的公司,不过一方面中国人的血统比较单一,广州人民再怎么晒黑也不会联想到自己是非洲人去;另一方面,中国人都实在,有钱查祖宗的故事还不如花钱倒腾自己。所以暗搓搓搞亲子鉴定的公司越开越多,祖宗鉴定就没啥动静了。
不过也不是一直没消息,祖源鉴定也曾经有个大新闻,非常好玩,就是曹操墓的鉴定事件。
 
话说早些年前,中原某地发现了一个古墓,里面有两具男性尸体。专家鉴定后一致认为是曹操墓,两具尸体中一个是10来岁的曹操,另一个是60来岁的曹操。这个当然是笑话了,实际也反映了老百姓对考古的态度和对专家意见的看法。这个时候还得靠遗传学的专家来救场。
 

遗传专家们在国内首先找了几家自称是曹操后裔的人,抽了血,验了DNA,然后和曹植墓中挖出来的尸骨进行亲子鉴定,证明了这些人的家谱很靠谱,确实和曹植是一家的(不是曹植就是曹冲曹熊啥的,反正是曹家某先人,细节有点记不清了,勿怪)。然后从隔着快两千年的这两拨人中找到了共同属于曹家人特有的基因突变位点(SNP位点)。


再然后,去跟那个曹操墓中挖出来的尸骨进行DNA鉴定,结果发现这个人也有曹操家族的特有基因突变。于是,就可以推测这个墓里面埋的很可能是曹操了。


当然,严格来说,墓里面这个依然可以是“操丕真爽”主干或者旁支中的任何一个人。不过结合墓葬品分析还是曹操可能性大;毕竟在坟墓中塞上各种伪装,让后世盗墓的误认为自己是自家老祖宗的做法,不能说不可能,但概率还是低了点。说个题外话,这个过程中,这帮遗传专家们还顺便把挖出来的夏侯惇还是夏侯啥的基因给做了,证实了曹家和夏侯家没有血缘关系,顺道给历史上两者是一家人的千年传闻划了个句号。


 
以上这种搞祖宗鉴定的DNA检测方案,用得不是上一回讲的亲子鉴定的STR分析技术,而是SNP分型技术,因为STR分型技术位点太少,不够用了,上次我们说了STR一般一次也就能做20个位点,祖宗太多,不够区分。
SNP(单核苷酸多态性位点)可以简单地理解为基因突变。前面讲进化的时候有说过,每个人和自己父母的基因都不会完全一样,遗传过程中总有一些位点会发生基因突变;就算是同卵双胎,DNA上也不会完全一样,总会有一些突变是特有的;我们管这些突变就叫做SNP位点。SNP属于量大管够,国际数据库dbSNP里排上号的都已经有3亿多个了,每个人都能给你妥妥地分开。


怎么拿SNP来认祖归宗呢?很简单,找那个特别的独一无二的SNP就行了。

比方说曹操本人在Y染色体上发生了一个非常特别的突变,这个突变就他有,以前的人从来都没有出现过;那么这个突变就成了曹操和曹操男性后裔的标志。所有的曹操后代(男性)都会有这个突变,而其他人就没有。如果某个人(男性)做SNP分析发现了这个突变,那他就十有八九是曹操的后代了。(女性祖先就查线粒体)


这种用来检测已知SNP位点的信息、进行基因分型最有代表性的技术就是SNP芯片。一次性可以检测几十万到上百万个SNP位点的信息,这么多位点专门用来搞祖宗鉴定显然是吃饱了撑的,毕竟没有谁需要去鉴定是否存在几十万分之一的xx血统,就算有王位要继承也用不上,20个点的STR亲子鉴定足够了。
 


早期SNP芯片主要是用来做疾病的关联分析的。比方说肺癌吧,找一堆得肺癌的病人做基因芯片;把结果拿去跟普通人的SNP结果进行对比;发现这些得肺癌的病人大多数都在某个特定SNP位点上存在突变,而普通人则没有。

于是就可以得出这样的结论,凡是有这个基因突变的人,都容易得肺癌,应该早预防、早诊断、早治疗。


这样的发明能够让人早期预测肿瘤、高血压、糖尿病、老年痴呆等等好多好多疾病,简直是健康的终极福音。于是一下子就火了,上文说的美国公司23 and me就是靠做这个发达的,特别火爆,国内也有好多跟风的,赚了不少钱。直到被美国FDA叫停之后国内才算是消停了一点。叫停倒不是因为这个技术不好或者理念不对,关键在于解释上。这些结果说到底就是个参考,不但不是确诊,很有可能还是错误的,拿来预测疾病解释起来非常复杂。这一点大多数的医务人员都搞不明白,也说不清楚,更别说普通人了;所以叫停普通人的应用,限制到特定医疗范围内应用比较保险。这个领域非常有意思,用得好有奇效,用不好要人命,今天就不多说了,以后有空再讲。
 
遗传学家使用SNP芯片主要用来做染色体的缺失和重复分析,看中的就是芯片技术的位点多,密度高。太细的就不列了,这么说吧:
    SNP芯片分辨率比染色体核型分析提高了50倍以上;
    SNP芯片可以比染色体核型分析多检查到几百~上千种疾病;
    SNP芯片在产前或产后遗传病检测中,比染色体核型分析检出率提高一倍以上;
因为以上的优点,所以不论是产后遗传病还是产前超声异常,基因芯片在多年前就已经被认定为基本首选检测项目。
 


除了分辨率高,SNP芯片最早是用来做亲子鉴定的高级版-祖宗鉴定的,具有充分的个体基因信息。所以对于异常结果仔细分析后,芯片还能用于推测是在怀孕前精子、卵子出了问题?还是怀孕后宝宝发育过程中出的问题?发生这些异常的可能原因是什么,该怎么确认,下一胎会不会还是这个样子,有没有办法预防,自己生还是做试管婴儿?等等。

而且,还是因为有了SNP信息,结合遗传过程中染色体交换、重组的机制,根据SNP芯片的位点分型信息,可以对染色体嵌合异常是什么来源,什么比例、预后如何进行分析和推测。下面的文章里面也有例子看不懂没关系,反正只要知道哪怕是一模一样的基因检测结果,也可以有SNP的不同,从SNP芯片可以判断出来哪个有问题,哪个没问题。

具体分析细节可以点击查阅以前的文章,有详细说明(如何使用BAF结果分析嵌合三体与UPD)。

再放一个:M I不分离致16三体经挽救形成二/三体嵌合羊水的芯片结果分析流程,兼论illu家zh-8和Affy家HD芯片的差异


 当然大也有大的难处:

一方面,芯片是个多细胞的综合性结果,有些结论是推导出来的,准确率不错,但说确诊还是需要交叉证据和直接证据。所以很多时候需要染色体核型、FISH、PCR等方法来复核;或者需要父母、甚至祖辈抽血进行复查才能确定。这个是经常被病患质疑,怀疑医院乱收钱的重要原因。


其次、芯片本身的产品稳定性和实验操作的稳定性就不如QF PCR。毕竟QF PCR只需要同时完成最多20个位点的检测,而SNP芯片则需要同时完成几十万到上百万个位点的检测;就算方法再优化,还是难免波动。所以团标认为采用基因芯片进行产前诊断的话,如果检测到嵌合比例在30%以上时,可以认为是比较可靠的,值得引起关注;如果低于30%就不一定了,有可能是实验误差,在没有其他临床提示的情况下,可以不予处理。

这一点非常重要,现在医疗技术发展太快,不是所有医生都有机会每个新技术、新实验都自己去做过的,于是就会搞不清哪些实验结果是用来信的、哪些是用来参考的、哪些是当背景板的;以至于把背景板拿来当成异常结果去处理,就会出问题。

现在从团体标准的层面上把不必要的结果给排除出去,可以让临床医生容易很多,病患也会轻松很多。


第三、芯片结果分析、解释和病人的理解都超有难度。SNP芯片的分辨率高了、检出率高了,医生的分析水平、知识储备等各种能力的要求也原地升天了,原本熟悉100个病就能算神医了,现在直接变1000个病了,而且每天还在增加了。这就要命了,学习起来真没这么快,所以医生难当了。

而且,病人也难当了!以往很多疾病、很多检查还能随便百度一下,看几个网页就能搞明白,甚至自己上手切包皮啥的也不是不可能。但是对于基因、对于芯片、对于遗传学分析来说,那就真不是一般的复杂,不学上几年连门边都摸不到。

照以往的习惯,有些人搞不明白的时候会去找个医生朋友问问。对于基因检测来说,这招也不灵了。别说跨专科知识差距太大了,哪怕是专业的遗传咨询师,在针对个人的情况做专门准备之前也不敢说就能说明白了。这也是为什么很多时候看遗传门诊,会要求病患把资料留下,回头查查资料、讨论后再回复的原因。

有些人会觉得,连这都不熟啊还得,你这个单位这个人不专业啊。还是老问题,几千个病,大多数都是一辈子见不了几个病人的,你说谁能背的下来?而且了,这年头医学知识每天都在突飞猛进,昨天还靠谱的说法,今天很可能就被怼回去了。不搞不懂装懂,及时查资料,搞清楚了再建议,这才正正是专业的表现,估摸着猜个相似的遗传病,然后瞎说一气,那才是不专业。


再补个例子吧,SNP芯片会出现非常多的以前没有见到过的染色体上的缺失或者重复。这些问题有可能异常、也可能正常,医生分析起来要查非常多的资料,再结合病患的实际情况,还可能需要补充各种检查,才能给出一个稍具倾向性,不能算决定的结论。

因为全世界都没有确定性的结论,所以很可能换个单位、换个医生问问,解释还就不一样了。

这个事儿很抓狂,但真没办法,这个世界我们只是理解了一小部分。碰到了除了一起商量,还真没有特别的好办法。

这也是我一直在努力搞科普的原因,多点相互理解,能够坐下来好好谈谈,就已经成功一半了,感谢支持。


对了,还得补一句,基因芯片是个总称,有些芯片是专门看某个疾病的单独几种病因,有些只能看少量的缺失、重复,有些不能看SNP位点,有些还能看基因表达的情况,等等。玩具车和火星车,火车都叫车,但明显不是一码事,别给忽悠了。上文说的主要是针对100k以上分辨率的SNP分型的全基因组CMA芯片。


鉴定项目推荐

北京司法亲子鉴定
北京司法亲子鉴定
费用价:2.6-3.2千
热度:
我要鉴定
上海司法亲子鉴定
上海司法亲子鉴定
费用价:2.6-3.2千
热度:
我要鉴定
上海上户亲子鉴定
上海上户亲子鉴定
费用价:2.6-3.2千
热度:
我要鉴定
上海个人亲子鉴定
上海个人亲子鉴定
费用价:2.6-3.2千
热度:
我要鉴定
北京司法亲子鉴定
北京司法亲子鉴定
费用价:2.6-3.2千
热度:
我要鉴定
鉴定项目排行榜
  • 1广州司法亲子鉴定39
    广州司法亲子鉴定
    收费价:2.5-2.6千
    热度:
    查看详情>>
  • 2广州司法亲子鉴定39
    广州司法亲子鉴定
    收费价:2.5-2.6千
    热度:
    查看详情>>
  • 3广州司法亲子鉴定39
    广州司法亲子鉴定
    收费价:2.5-2.6千
    热度:
    查看详情>>
  • 4广州司法亲子鉴定39
    广州司法亲子鉴定
    收费价:2.5-2.6千
    热度:
    查看详情>>
  • 5广州司法亲子鉴定39
    广州司法亲子鉴定
    收费价:2.5-2.6千
    热度:
    查看详情>>
  • 6广州个人亲子鉴定29
    广州个人亲子鉴定
    收费价:2.4-2.8千
    热度:
    查看详情>>
  • 7广州个人亲子鉴定29
    广州个人亲子鉴定
    收费价:2.4-2.8千
    热度:
    查看详情>>
  • 首页 |平台简介 |法律声明 |鉴定热搜 |正在咨询 |联系我们